Заводоуковск- известен как деревня Уковская с 1729 года. В 1729 году в деревне имелось 8 дворов, в 1749 году — уже 25 дворов. В 1740—1744 годах верхотурскими купцами М. Походяшиным и А. Власьевским был основан Уковский винокуренный завод. В конце XVIII — начале XIX веков винокуренные заводы перешли в казённое ведомство. В конце концов, Уковский винокуренный завод прекратил своё существование, и только в 1860-е годы XIX века производство алкоголя в более прогрессивном промышленном масштабе возродил знаменитый сибирский предприниматель польского происхождения Альфонс Фомич Поклевский-Козелл .
В 1787 году деревня стала волостным селом Заводоуковским, в селе на тот момент имелось 180 домов, проживало 980 мужчин и 988 женщин.
Название села можно расшифровать как «завод на Уке», и связано оно с расположенным в селе винокуренным заводом. Другая версия связана с распространённой в Сибири в XVIII—XIX веках традицией основания специальных поселений — «заводов», предназначенных для отдыха направляемых в ссылку каторжан.
В 1844 году было основано Заводоуковское торгово-промышленное предприятие «Товарищество братьев Колмаковых». При нём имелись мукомольное, салотопенное, пряничное, крахмально-паточное производства
В начале XX века строится железная дорога Тюмень — Омск. Первый рабочий поезд на станцию Заводоуковскую пришёл в мае 1912 года, а регулярное движение по северной ветке Транссиба началось в конце 1913 года. Вместе с железной дорогой строятся здание вокзала, водонапорная башня, казармы для рабочих.